
Filozofski fakultet Družbe Isusove u Zagrebu nastavlja isusovačku tradiciju u poučavanju filozofije koja je započela 6. studenog 1662. godine uspostavom Filozofskog studija na Zagrebačkom Kolegiju koji je kasnije postao kolijevkom Zagrebačkog Sveučilišta. Taj je rad prestao ukinućem isusovačkog reda 1773. godine. Novija povijest isusovačke filozofske tradicije u nas počinje osnivanjem Filozofskog instituta 1937. godine s trogodišnjim studijem filozofije, koji je onda na crkvenim filozofskim fakultetima vodio do stupnja licencijata iz filozofije. Djelatnost tog Instituta nije se prekidala sve do danas. Kad je dana 31. srpnja godine 1989. Kongregacija za katolički odgoj (Kongregacija za sjemeništa i učilišta) pri Svetoj stolici svojim Dekretom br. 365/87/18 naš Filozofski studij podigla na razinu Filozofskog fakulteta, dala mu je pravo podjeljivanja akademskih stupnjeva: bakalaureata (diplome), licencijata (magisterija) i doktorata iz filozofije. Na temelju članka 103. i članka 104. Zakona o znanstvenoistraživačkoj djelatnosti Republike Hrvatske Ministarstvo znanosti je rješenjem od 7. listopada 1992. godine naš Filozofski fakultet upisalo u Registar znanstvenoistraživačkih organizacija i jedinica kao znanstvenoistraživačku organizaciju u znanstvenom području filozofija - pod registarskim brojem 199.
Od početka akademske godine 1993/94. Fakultet omogućuje jednopredmetni (studij religijske kulture) odnosno dvopredmetni studij i to: smjer A - studij filozofije i smjer B - studij religijske kulture. Taj studij traje četiri godine (8 semestara) i osposobljuje studenta za zvanje profesora filozofije i religijske kulture na srednjim školama, a prikladan je posebno za one studente koji ne namjeravaju studirati teologiju.
Senat Sveučilišta u Zagrebu je na svojoj 5. sjednici, održanoj 8. veljače 1994. godine donio odluku br. 01-233/1-1994. kojom se program dvaju spomenutih studijskih smjerova koje izvodi naš Fakultet (A - Studij filozofije i B - Studij religijske kulture), prihvatio kao dio Hrvatskih studija Sveučilišta u Zagrebu, a 24. studenoga 1995. godine donošen je i Pravilnik tih studija.
Kongregacija za katolički odgoj (za sjemeništa i učilišta) svojim je dekretom br. 1059/94/10 od 13. ožujka 1995. godine odobrila dopunjene Statute našega Fakulteta i time mu podijelila pravo da studentima studija filozofije i religijske kulture podijeli diplomu akademskog stupnja bakalaureata filozofije i religijske kulture. Godine 2000. ista je Kongregacija Statute trajno odobrila.
Glavna je svrha Fakulteta promicanje filozofskog studija i to:
a)
istraživanjem filozofskih problema,b)
sustavnim poučavanjem filozofskih grana i buđenjem filozofske refleksije u studenata tec)
pripravljanjem studenata za učiteljsku i istraživačku ulogu na području filozofije.Svrha Studija religijske kulture sastoji se u osposobljavanju studenata (laika) za poučavanje predmeta religijske kulture odnosno etike na srednjim školama i za rad na područjima koja se bave religijskom problematikom.